Гани Бейсембаев родился в 1969 году в Кызылординской области.
Окончил Алматинский государственный университет им. Абая.
Трудовую деятельность начал в 1986 году в должности заведующего автоклубом отдела культуры района Шиели.
В 1989-1990 гг. — учитель казахского языка.
В 1990-1995 гг. — заместитель директора по учебно-воспитательной работе средней школы.
В 1995-1997 гг. — директор средней школы.
В 1997-2000 гг. — ученый секретарь, советник президента Казахской академии образования им. Ы. Алтынсарина МОН РК.
В 2000-2001 гг. — руководитель отдела образования г. Капшагай.
В 2001-2006 гг. — директор центра дополнительного образования.
В 2006-2020 — генеральный директор международного центра образования.
В 2006-2007 гг. — директор технико-экономического колледжа.
В 2020 году являлся директором Республиканского научно-практического центра «Учебник» МОН РК.
С декабря 2020 года по настоящее время являлся президентом Национальной академии образования им. Ы. Алтынсарина МОН РК.